具有抗艾滋病毒活性的多肽T22([T_(yr)~(5,12),L_(ys)~7]-Polyphemusin Ⅱ)骨架构象模拟

来源 :科学通报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jy02324491
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
用势能平滑搜索方法,在平滑修饰的势能面上对具有抗艾滋病毒HIV-l活性的肽T22([T5,12yr,L7yr]-PolyPhemusin Ⅱ)骨架结构进行了全程搜索,得到该分子骨架结构在修饰势能面上的分子构象全集.用多构象优化方法,选择较适用于肽OPLS力场,采用GB/SA水溶剂模型,优化上述构象集,得到T22骨架结构在水溶液中优势构象集.结果表明势能平滑搜索与多构象优化相结合的构象分析方法是解决含有环结构的柔性分子构象分析中多重最小问题的有效方法. The potential structure of the peptide T22 ([T5, 12yr, L7yr] -PolyPhemusin Ⅱ) with anti HIV HIV-1 activity was searched through the smooth modified potential energy surface using the potential energy smoothing search method. Modification of the complete set of molecular conformations on the potential energy surface. Using the multi-conformation optimization method, we chose the OPLS force field which is more suitable for the peptide and optimized the conformation set using GB / SA water solvent model to get the conformational set of T22 skeleton structure in aqueous solution. The results show that the method of conformation analysis combining potential smoothing search and multi-conformation optimization is an effective method to solve the multiple minimum problem in the conformational analysis of flexible molecular structures with ring structures.
其他文献
期刊
主办单位:中国奶业协会中国农业科学院农业信息研究所本刊特点经国家新闻出版署批准,2002年正式创刊集前瞻性、权威性、时效性和实用性为一体,是为全行业服务的综合性、指导
请下载后查看,本文暂不支持在线获取查看简介。 Please download to view, this article does not support online access to view profile.
期刊
请下载后查看,本文暂不支持在线获取查看简介。 Please download to view, this article does not support online access to view profile.
期刊
研究了几种分子筛在乙基化反应中的积炭过程,并与分子筛的酸性、孔结构等参数关联,阐明了ZSM-5分子筛催化剂的酸中心对积炭起着主要作用。酸强度越高,越容易积炭,酸量越大积
2013年,自治区新闻出版局人事处要紧紧围绕局中心工作,把学习贯彻党的十八大精神作为重中之重,努力建设高素质干部队伍和人才队伍。一、抓好学习,增强实效创新学习形式,拓展
当今世界,绿色发展已成为潮流。绿色发展,就是要发展环境友好型产业,降低能耗和物耗,保护和修复生态环境,发展循环经济和低碳技术,使经济社会发展与自然相协调。为了紧跟世界
报导了邻香草醛与丙氨酸所形成的席夫碱配体及其Cu(Ⅱ),Zn(Ⅱ),Ni(Ⅱ)的配合物,并对它们进行了表征和抗菌活性试验,结果表明合成的新化合物与预期的相符。化合物中除了o-VACu
目的探讨CD56,CD95,Ki-67,p53,bcl-2,HMB45和S-100在恶性黑色素瘤中的表达,旨在提高黏膜无色素性恶性黑色素瘤的病理诊断率,减少误诊和漏诊,并为临床估计预后、选择治疗方案
在潜江电视台播放的《熊口成校教学生产示范经营服务一体化》电视片中,有一壮汉正在示范基地向几百名科技致富带头人讲授。他,就是熊口镇成校校长黄敬东。黄校长以自己的胆