湖北和广西辣椒脉斑驳病毒的检测及遗传多样性分析

• 作 者: 李桑桑 胡荣 罗香文 李诗君 卜珊 张宇 刘勇 张松柏
• 机 构: 湖南大学研究生院隆平分院,湖南省农业科学院植物保护研究所
• 出 处: 南方农业学报
• 发表日期: 2020年7期
• 关键词: 辣椒脉斑驳病毒 RT-PCR 系统发育分析 重组 湖北 广西 Pepper veinal mottle virusRT-PCRphylogenetic anal
• 基金项目: 国家自然科学基金项目(317017765)

【目的】研究辣椒脉斑驳病毒(Pepper veinal mottle virus,PVMV)的分布及遗传变异,为明确该病毒在我国的流行扩散分子机制提供理论依据。【方法】利用特异性引物反转录PCR(RT-PCR)检测从湖北宜昌及广西南宁和百色采集的48份疑似感染PVMV的辣椒样本;采用常规Sanger测序测定PCR产物序列,序列采用MEGA 5.0构建系统发育进化树,采用RDP等算法分析其可能的重组事件;采用DnaSP v5分析病毒株系不同群体之间的基因流及基因差异。【结果】从48份辣椒样本中检测到5份样本