甘蔗新基因ShUGT2的生物信息学分析及亚细胞定位

来源 :热带农业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangshuo3246
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UDP-糖基转移酶在植物体内负责糖基化修饰,对植物的生长发育起着关键作用。以甘蔗品种ROC22为供试材料,提取成熟叶片总RNA并反转录合成cDNA,经PCR扩增获得ShUGT2基因cDNA全长序列,对其进行生物信息学、亚细胞定位和组织特异性表达分析。结果表明:ShUGT2含有1782 bp的完整开放阅读框,编码593个氨基酸,其编码蛋白与高粱UDP-糖基转移酶同源性达到92.45%。ShUGT2编码蛋白不稳定系数为48.68,疏水性指数-0.338,是一种亲水性蛋白;在20~42个氨基酸的位置,有一个跨膜
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