基于转录组的三月李及其红肉突变体Expansin基因家族鉴定及分析

• 作 者: 方智振 林炎娟 姜翠翠 周丹蓉 潘少霖 叶新福
• 机 构: 福建省农业科学院果树研究所/福建省落叶果树工程技术研究中心
• 出 处: 福建农业学报
• 发表日期: 2020年9期
• 关键词: 李 转录组 expansin家族 生物信息学分析 表达分析 Plumtranscriptomeexpansin familybioinformatics ana
• 基金项目: 福建省科技计划公益类专项(2018R1013-4、2018R1013-1),福建省自然科学基金项目(30471225),福建省农业科学院青年英才计划项目(YC2015-9),福建省农业科学院创新团队建设项目(STIT2017-1-4)

【目的】Expansin是广泛存在于植物中的一类细胞壁蛋白,通过调节细胞壁柔韧性在植物生长发育过程中发挥作用。本研究旨在分析Expansin基因家族特征及其在果实成熟过程中的表达模式,并比较Expansin基因在三月李及其红肉突变体之间的差异表达。【方法】基于三月李及其红肉突变体果实成熟过程的转录组数据,采用生物信息学分析方法进行Expansin家族基因鉴定与分析。【结果】鉴定出33个李Expansin基因家族成员,编码蛋白长度在176~460 aa,分子量在19.21~51.33 kD,等电点4.62~