miR-181b对甲状腺癌发生发展调控机制转录组学方法分析

来源 :中华肿瘤防治杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:maly_soly
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目的 随着甲状腺癌发病率的提高,甲状腺癌的筛查与治疗受到了社会的关注.微小RNA在甲状腺肿瘤的发生和发展中发挥着重要作用.本研究旨在运用高通量测序技术和生物信息学技术来寻找与miR-181b相关的差异表达基因及信号通路并探讨其临床应用价值.方法 选取甲状腺癌细胞BCPAP为研究对象,将miR-181b-5p的模拟物、空白模拟物和miR-181b-5p的抑制物及空白抑制物分别转染进BCPAP细胞,荧光定量PCR检测细胞miR-181b-5p的表达,高通量测序检测差异基因;用Cluster Profiles 3.0.5软件进行GO、KEGG及reactome富集分析.结果 经验证转染成功后,通过测序检测,与转染空白模拟物的细胞相比,在转染miR-181b-5p模拟物的细胞中,有149个基因的表达量升高,fold change>2,P<0.05;同时有416个基因的表达量下降了,fold change>2,P<0.05.GO、KEGG及Reactome富集分析显示,下调的416个基因主要被富集在了白三烯生物合成、代谢等过程,并且差异有统计学意义,P<0.05.通过蛋白印迹技术验证,miR-181b-5p模拟物中SYK蛋白表达较对照组明显减少,差异有统计学意义,P=0.002(n=3).结论 在甲状腺癌中,miR-181b高表达可能通过抑制抑癌基因SYK表达,促进甲状腺癌的发生和发展,为甲状腺癌潜在的诊断及治疗的靶点.
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