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目的 了解宏基因二代测序技术(mNGS)在痰菌阴性肺结核患者诊断中的临床价值.方法 回顾性分析2019年1月——2020年9月徐州市中心医院呼吸科收治的临床诊断为肺部感染、痰菌阴性、血T-SPOT阳性、经验性治疗无效,临床拟诊肺结核并且行肺泡灌洗液/痰液mNGS检查,或者行CT引导肺穿刺活检的患者资料,以疾病随访1月后的临床诊断为最终诊断.结果 最终纳入42名患者,22例行肺泡灌洗术,1例因无法耐受支气管镜检查予以深部吸痰留取合格痰标本送检mNGS,1例因反复咯血留取血痰标本送检mNGS,18例行CT引导肺穿刺活检.CT引导肺穿刺对于T-SPOT阳性的拟诊断肺结核的患者而言,其诊断结核分枝杆菌的敏感性、特异性、阳性预测值及阴性预测值分别为77.8％、100.0％、100.0％、81.8％,而mNGS均高达100.0％.结论 对于临床拟诊肺结核的病人,可通过送检肺泡灌洗液或痰液行mNGS检测在短时间内得到确切的病原菌信息,并且在确诊肺结核方面mNGS的诊断价值要明显优于CT引导肺穿刺活检(P=0.038).