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随着我国对能源、环境、生态、农产品质量日益重视，以及发展可持续农业战略的实施和无公害有机绿色农业的兴起，微生物肥料以其能减少化肥用量、保护生态环境、活化土壤有机质，提高农产品产量和质量等优点，逐步被人们认识和应用。尤其是我国人口众多，耕地有限，对粮食和肥料的需求日益迫切，做为化肥生产原料和能源的石油资源日趋紧张，依赖有限的资源难以维持农业的持续发展，势必要发展微生物肥料（以下简称生物肥料）。生物肥料不仅可以补充化肥不足，而且可以被列为绿色食品用肥进入商品生产，成为新兴的“绿色产业”，在农业生产中发挥其应有的经济效益、社会效益和生态效益。
但是，由于人们目前对生物肥料的作用有不同看法：一种看法认为可以替代化肥；另一种看法则认为根本不能替代化肥。实际上这两种看法都有片面性，生物肥料与化学化肥有很强的互补性，单一施用生物肥料是不能满足高产农业对养分的需求，单一施用化学肥料不利于保护环境，不能改良土壤，也不利于提高农产品质量。在无公害有机绿色农产品生产中，只有二者有机结合，配合施用，才能做到节省化肥，改良土壤，提高农产品质量，这才是生物肥料的发展前景。
近年来我国各地已开始生产和销售生物肥料与化学肥料混配的产品，也称之为掺混肥料，这是新兴起的有机无机掺混肥料，开始在农业生产中应用。但由于生物肥料产品在生产和施用方面尚存一定缺陷，未能在农业生产中被广泛采用，究其原因有：
一、生物肥料产品不合格
由于生物肥料生产设备和技术要求比较高，从接种、培菌、扩繁到批量生产，涉及到生产设备和技术要求很严格，对温湿度及氧气、无菌操作等条件必须达到标准，既要有合格的生产设备和监测手段，又要生产环节上具备合格的能掌握微生物生产技术的员工，才能生产出合格的生物肥料。
目前有些生物肥生产厂家（主要是一些小厂家）既没有能掌握微生物生产程序的技术人员、又没有质量监测手段和监测设备，也生产生物肥向市场销售，可以说这些厂家不具备生物肥料的生产条件，所产的生物肥料质量低劣，应列为不合格产品。
二、生物肥料在生产销售过程中监督体系不完善
目前对肥料的质量监督部门，重视对化学肥料的质量检查监督，忽视对生物肥料的质量监督，至使在市场上出现不合格的生物肥料无人问津。
三、农民对生物肥料特性认识不足
许多农民对生物肥料在贮运、施用过程中与化学肥料同样对待，不知生物肥料是活体肥料，在贮运、施用技术上有别于化学肥料，常造成施用效果不佳。
尽管生物肥料在生产和应用方面，目前尚存一定缺陷，人们对其认识亦有片面性，随着我国各地对生物肥料的研究、生产和应用技术的进步，监测体系逐步完善，目前存在的不健全阰段将逐步完善，生物肥将在农业生产中发挥应有的作用。
但是，由于人们目前对生物肥料的作用有不同看法：一种看法认为可以替代化肥；另一种看法则认为根本不能替代化肥。实际上这两种看法都有片面性，生物肥料与化学化肥有很强的互补性，单一施用生物肥料是不能满足高产农业对养分的需求，单一施用化学肥料不利于保护环境，不能改良土壤，也不利于提高农产品质量。在无公害有机绿色农产品生产中，只有二者有机结合，配合施用，才能做到节省化肥，改良土壤，提高农产品质量，这才是生物肥料的发展前景。
近年来我国各地已开始生产和销售生物肥料与化学肥料混配的产品，也称之为掺混肥料，这是新兴起的有机无机掺混肥料，开始在农业生产中应用。但由于生物肥料产品在生产和施用方面尚存一定缺陷，未能在农业生产中被广泛采用，究其原因有：
一、生物肥料产品不合格
由于生物肥料生产设备和技术要求比较高，从接种、培菌、扩繁到批量生产，涉及到生产设备和技术要求很严格，对温湿度及氧气、无菌操作等条件必须达到标准，既要有合格的生产设备和监测手段，又要生产环节上具备合格的能掌握微生物生产技术的员工，才能生产出合格的生物肥料。
目前有些生物肥生产厂家（主要是一些小厂家）既没有能掌握微生物生产程序的技术人员、又没有质量监测手段和监测设备，也生产生物肥向市场销售，可以说这些厂家不具备生物肥料的生产条件，所产的生物肥料质量低劣，应列为不合格产品。
二、生物肥料在生产销售过程中监督体系不完善
目前对肥料的质量监督部门，重视对化学肥料的质量检查监督，忽视对生物肥料的质量监督，至使在市场上出现不合格的生物肥料无人问津。
三、农民对生物肥料特性认识不足
许多农民对生物肥料在贮运、施用过程中与化学肥料同样对待，不知生物肥料是活体肥料，在贮运、施用技术上有别于化学肥料，常造成施用效果不佳。
尽管生物肥料在生产和应用方面，目前尚存一定缺陷，人们对其认识亦有片面性，随着我国各地对生物肥料的研究、生产和应用技术的进步，监测体系逐步完善，目前存在的不健全阰段将逐步完善，生物肥将在农业生产中发挥应有的作用。