富集分析工具PAEA(Principle Angle Enrichment Analysis)简介

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样本基因的差异表达是生物学和医学研究的核心。提供一种新的多变量基因富集分析方法,称为主角富集分析(PAEA)。PAEA方法的主要特点是使用"主角"几何学概念,来量化样本基因的富集特点。利用真实的基因数据,把其他基因富集分析工具和PAEA进行对比测试。从大量的转录因子基因敲除或过表达研究中,用不同方法对基因表达特征进行富集分析,检测各种转录因子的富集度;同时使用ChIP-Seq数据创建的基因组库富集分析相同的转录因子。通过对比发现,PAEA优于一系列包括GSEA在内的常用基因富集分析工具;不仅如此,PAEA
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