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水通道蛋白是一类具有同源性的内在膜蛋白家族。目前在哺乳动物中发现了13种亚型,广泛分布于动植物的组织中,各自介导着不同细胞膜的跨膜水转运,与很多疾病的发生发展有重要关系。AQP3、AQP4在消化系统中分布广泛,在胃肠道正常生理功能以及病理功能中起着重要作用。AQP3、AQP4与很多胃肠道疾病如慢性胃炎、腹泻、便秘、胃癌、结肠癌等密切相关。通过查阅大量文献发现很多学者对AQP3、AQP4与胃肠疾病之间的关系,以及中医药治疗胃肠疾病前后AQP3、AQP4是否有变化进行了深入的研究。本文将近几年的研究成果进行综述,希望能对中医药治疗胃肠疾病提供新思路。