三维氨基酸结构描述子矢量SVRDF及其在肽QSAR中的应用

• 作 者: 仝建波 张生万 成素丽 李改仙
• 机 构: 山西大学化学化工学院,晋中学院化学化工系
• 出 处: 药学学报
• 发表日期: 2007年1期
• 关键词: 氨基酸 肽 SVRDF描述子 定量构效关系 偏最小二乘 amino acids peptide SVRDF quantitative structure
• 基金项目: 山西省工业攻关项目和山西省首届青年拔尖创新人才专项基金资助项目（2006031204）.

为了建立一种新型氨基酸结构描述子并用于多肽定量构效关系研究，本研究从天然氨基酸150个radial distribution function （RDF）指数经主成分分析得出一种新3D氨基酸描述子-SVRDF（ principal component scores vector of radial distribution function），应用该描述子并通过偏最小二乘（PLS）对苦味二肽、催产素及促凝血酶原激酶抑制剂3个体系建立定量构效关系模型。对3个体系建模复相关系数（R^2 cum）与交互检验复相