鸡传染性支气管炎病毒国内分离株核蛋白基因的克隆与序列分析

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本研究参考已发表的鸡传染性支气管炎病毒核蛋白基因序列,设计了一对核蛋白基因的特异性引物NP5、6,经RT-PCR扩增得到了IBV国内分离株DB株、XJ株、DC株、HD株的1199bp的核蛋白基因片段,并进行了克隆和序列测定。将4个国内分离株核蛋白基因的序列与国外发表的参考毒株的核蛋白基因序列进行了比较和分析,结果显示这4个毒株与澳大利亚群的参考毒株亲缘关系最为密切,核苷酸序列同源性86%-91%。其中DC株发生了较大程度的变异。国内分离株核蛋白基因核苷酸的变异引起了蛋白质二级结构的部分改变。
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