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真核细胞中mRNA的半寿期差异明显,mRNA的降解是基因表达过程中一个重要的步骤,现已肯定在真核细胞中至少存在3种mRNA降解方式,即依赖于脱腺苷酸的降解,无义密码介导的mRNA的降解和核酸内切酶的水解。其中依赖于脱腺苷酸的降解是细胞内大部分mRNA降解的主要途径。另外,mRNA的稳定性还受多种因素影响,现已发现许多影响mRNA稳定性的“顺式因子”和“反式因子”。此外,mRNA降解可能与某些疾病的发生有关。