目的 寻找胰腺导管腺癌（PDAC）预后相关基因并探讨其分子调控机制。方法从美国国立生物技术信息中心基因表达数据库中选取102例包含完整临床生存资料的 PDAC 患者的基因表达谱数据。从 Transfac 数据库中收集到106个转录因子调控基因集合。使用 PicTar 和 TargetScanS 算法收集到715个 miRNA 靶向调控基因集合。生物学通路数据来源于京都基因与基因组百科全书（KEGG）。已知癌基因数据来自癌基因普查（CGC）数据库。使用单因素 Cox 比例风险模型分析基因表达谱数据与生存时间的相关性，得到全基因组范围内的与生存相关的候选基因。使用超几何分布算法分析3种数据集的基因富集情况。使用 BH-FDR 算法进行多重矫正检验（要求假阳性率＜0．05）。采用 Kaplan-Meier 法对 PDAC 患者进行生存曲线分析。结果单因素 Cox 比例风险模型分析102例PDAC 患者数据后显示，有273个基因与患者的生存时间显著相关（P ＜0．0001）。将273个生存基因针对106个转录因子调控基因集合进行富集分析，得到12个富集生存基因的转录因子靶基因集合。将273个生存基因针对715个 miRNA 靶向调控基因集合进行富集分析，得到11个富集生存基因的miRNA 靶向调控基因集合。将273个生存基因针对 KEGG 通路数据进行富集分析，得到15个富集生存基因的生物学通路。生物钟周期基因2可能在转录水平受到转录因子 CCAAT 框/增强子蛋白（CEBPA）的调控，同时在转录后水平受到 miRNA-32的调控，进而通过昼夜节律通路影响 PDAC 的预后。102例 PDAC 患者按生物钟周期基因2表达量从高到低排序，前51例归为生物钟周期基因2高表达组，其余归为生物钟周期基因2低表达组，行 Kaplan-Meier 生存分析后显示，生物钟周期基因2与PDAC 的预后显著相关（P ＜0．01）。结论CEBPA/miRNA-32/生物钟周期基因2及其相关的生物钟节律通路可能是干预 PDAC 发展的靶通路，与 PDAC 预后相关。
生物钟周期基因2与胰腺导管腺癌预后的相关性分析
【摘 要】
：
目的 寻找胰腺导管腺癌（PDAC）预后相关基因并探讨其分子调控机制。方法从美国国立生物技术信息中心基因表达数据库中选取102例包含完整临床生存资料的 PDAC 患者的基因表达谱数据。从 Transfac 数据库中收集到106个转录因子调控基因集合。使用 PicTar 和 TargetScanS 算法收集到715个 miRNA 靶向调控基因集合。生物学通路数据来源于京都基因与基因组百科全书（KEGG
【机 构】
：
第三军医大学第三附属医院肝胆外科,重庆400041,第三军医大学第三附属医院肝胆外科,重庆400041,第三军医大学第三附属医院肝胆外科,重庆400041,第三军医大学第三附属医院肝胆外科,重庆400
【出 处】
：
中华消化杂志
【发表日期】
：
2014年34期
论文部分内容阅读
其他文献
患儿男,10岁,间断黑便2个月余.患儿出生时左脚掌外侧、右前臂及舌上即有蓝色隆起性病灶,随年龄增长,病灶数量增多,病灶面积增大.4岁时外生殖器及左脚掌外侧病灶接受激光治疗.2年前出现面色苍白,偶有恶心、腹痛,口服铁剂后可好转.2个月前间断出现黑便.外院内镜检查提示食管、胃、十二指肠、全结肠、直肠散在分布紫红色隆起,予聚桂醇注射硬化治疗.术后患儿仍有间断黑便.体格检查见5个蓝色隆起性病灶,分别位于左
期刊
目的 获得我国健康人不同年龄及性别肛门直肠动力及感觉功能参数的正常值。方法收集4个医疗中心的健康受试者，按年龄分为3组：Ⅰ组为18～39岁，Ⅱ组为40～59岁，Ⅲ组为≥60岁。应用气液压毛细灌注系统和 Pc Polygraf HR 台式高分辨消化道动力监测系统测定受试者静息状态下肛门括约肌参数；嘱受试者模拟排便，记录与排便相关的参数；最后向气囊充气评估直肠肛门抑制反射（RAIR）及直肠排便感知功能
患者女,34岁,因腹胀10余天于2009年6月20日入院.入院前10余天无明显诱因下出现腹胀,呈进行性加重,伴尿少,每天排尿2～3次,每次量少,呈浓茶样,伴低热、盗汗、乏力、纳差.当地医院查血常规、肝肾功能均正常,HBV标志物阴性,肺部CT未见异常,腹部CT示腹水,子宫附件超声未见异常,考虑结核性腹膜炎可能.腹水常规示黄色混浊液,潘氏试验(++),有核细胞(++++),中性分叶核细胞为80×104
期刊
病历摘要患者男,57岁,因中上腹胀伴巩膜尿色黄染20 d于2013年7月22日入院.患者于入院前20 d无明显诱因出现反复中上腹胀,进食后加重,伴皮肤、巩膜黄染,浓茶色尿,白陶土样便,无放射性痛,无腹痛腹泻、发热畏寒等不适.近20 d来,症状逐渐加重,2d前出现皮肤瘙痒.既往5个月前有痛风病史,尿酸368.0 μmol/L,入院前8h右踝关节疼痛,踝关节活动稍受限.16、13年前曾有急性胰腺炎史,
期刊
目的 分析江西省急性胰腺炎(AP)患者的临床特征.方法 回顾性分析2007年至2012年住院确诊为AP的2 625例患者的病例资料,比较2007年至2009年和2010年至2012年两个时间段中AP患者性别、年龄和病因构成的变化.非正态分布的计量资料采用Mann-Whitney U检验,计数资料采用卡方检验.结果 2 625例AP患者中,2007年至2009年1 028例,2010年至2012年1
患者男,50岁,反复腹泻20 d.患者腹泻间断发作20 d,平均2～3次/d,初为黄色软便,后为水样便,排便前稍感腹痛,排便后可缓解,经抗感染治疗后症状可好转,但易反复,自诉体质量减轻.体格检查未及异常.血常规:WBC计数4.71×109/L,中性粒细胞0.677,Hb 121 g/L,血小板131×109/L.ALT 52 U/L.甲状腺功能、CA125、CA19-9、CEA、AFP、肾功能、电
期刊
目的 评价不同铋剂四联方案根除H.pylori的有效性和安全性.方法 收集2012年12月至2013年10月H.pylori阳性患者240例,均分为克拉霉素组、左氧氟沙星组、呋喃唑酮组、甲硝唑组,每日2次,每次口服枸橼酸铋钾220mg、埃索美拉唑20 mg、阿莫西林1 000 mg,同时各组分别每日2次,每次口服克拉霉素500mg、左氧氟沙星200 mg、呋喃唑酮100 mg、甲硝唑400mg,各
患者女,74岁,因10 h内便血1 000 mL于2013年1月23日入院.发病前因便秘行灌肠,排出干结粪便后反复出现便血.患者有高血压病、2型糖尿病病史10余年,平时血糖、血压控制不理想,长期便秘,否认痔疮病史.入院体检:体温36.8 ℃,脉搏84次/min,呼吸17次/min,血压146/72 mmHg(1 mmHg=0.133 kPa).神志清,精神差,贫血貌,心肺无异常,腹软,全腹无压痛、
期刊
2014年10月31日至11月2日,中华医学会第14次全国消化系病学术会议(The 14th Congress of Gastroenterology China,CGC 2014)在重庆隆重召开.本次大会由中华医学会和中华医学会消化病学分会主办,由重庆市医学会、重庆市医学会消化病学专业委员会、重庆市医学会消化内镜专业委员会和第三军医大学大坪医院承办.此次大会参会代表近5 000入,是2014年全
期刊
含PPI的标准三联H.pylori根除方案的根除率不断下降[1-2].中国井冈山共识[3]和欧洲MaastrichtⅣ共识[4]均建议将四联方案用于一线治疗.胃内抑酸不足可致根除H.pylori 药物的生物利用度下降[5].本研究对比含大剂量埃索美拉唑的四联疗法和三联疗法的H.pylori根除率。
期刊