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利用PCR技术扩增了采自长江宜昌江段和清江的8尾中国胭脂鱼线粒体DNA控制区全序列.研究发现该种具有脊椎动物线粒体控制区的一般结构. 在获得的958bp的碱基序列中,共检测出32个多态性核苷酸变异位点,多态位点比例为0.033.核苷酸的变异位点除一个为缺失外,其余全部为碱基转换. 变异位点主要集中在55~365bp高变异区,而其他区域突变稀少.个体的变异在0~1.36髎之间,表现出较大的个体多态性差异.中国胭脂鱼的线粒体控制区的变异远大于美国胭脂鱼(Moxostoma robustum)的0.016.