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大学自治已经成为一个历史的概念。随着民族国家的建立,中世纪的大学自治经历了现代演化,一些自治权被世俗政府所剥夺,大学自治的涵义已经发生了深刻的变化。当代大学已经演变成自主办学的机构。中世纪的大学自治与当代的大学自主办学共同点在于：都有一定的内部管理权,可以自主招生、教学和研究,授予学位。不同之处在于：外部环境的变化、外部势力干预的形式和程度不同,经费来源也不同。