β-KL离散量在识别DNA编码区域中的应用

来源 :生物信息学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：lovefish777

【摘要】

：

根据DNA序列的＇终止密码子＇及其＇逆补终止密码子＇的分布情况,给出一种新的DNA序列向量的构建方法,运用Shannon熵相关理论,对Jensen-Shannon离散量和KL离散量进行了修正和比较.试

【作者】

：

张景祥徐振源赵晓兵

【机构】

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江南大学理学院

【出处】

：

生物信息学

【发表日期】

：

2010年2期

【关键词】

：

DNA序列向量 Jensen—Shannon离散量 β-KL离散量 R14 Shannon Entropy Jensen - Shannon Divergenc

【基金项目】

：

基金项目：国家自然科学基金资助项目（（10871084））,江南大学理学院青年基金资助项目（20060928）.

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根据DNA序列的＇终止密码子＇及其＇逆补终止密码子＇的分布情况,给出一种新的DNA序列向量的构建方法,运用Shannon熵相关理论,对Jensen-Shannon离散量和KL离散量进行了修正和比较.试验表明,该方法在预测DNA序列的基因编码与非编码区边界的效率上是86%显著高于Bernaola等人提出的70%.

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