水稻稀穗突变体的遗传分析及基因的精细定位

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水稻稀穗突变体lax影响花序发育的主要特征是:穗轴上能形成正常的一次、二次枝梗,侧生小穗的发育被完全阻断,只在枝梗的顶端发育形成单个小穗,且小花呈多种异常变异.突变体与粳稻品种W11杂交获得F_2分离群体.以该F_2分离群体为基础,根据水稻基因组序列设计微卫星引物和CAPS标记,并进行连锁分析,将稀穗基因定位在水稻第1染色体长臂的CAPS标记HB2和微卫星标记MRG4389之间,与两标记间的距离均为0.14 cM,与CAPS标记LZ1共分离.RT-PCR分析结果显示,在稀穗突变体中与花器官发育相关的B功能基因OsMADS2,OsMADS4,OsMADS16以及C功能基因OsMADS3的转录水平明显下降,而A功能基因RAPIA的转录水平未受到影响. The main characteristics of rice spike mutant lax on inflorescence development are: the formation of normal primary and secondary branches on the cob, the development of lateral spikelets being completely blocked, and the formation of a single spike , And the floret showed a variety of abnormal variation.The mutant was crossed with the japonica rice variety W11 to obtain F 2 segregation population.Based on the F 2 segregation population, microsatellite primers and CAPS markers were designed according to the rice genome sequence and the linkage analysis was carried out, Located between the CAPS marker HB2 and the microsatellite marker MRG4389 on the long arm of rice chromosome 1. The distance between the marker and the two markers was 0.14 cM and was co-segregated with CAPS marker LZ1.RT-PCR analysis showed that in the spike mutant The transcript levels of OsMADS2, OsMADS4, OsMADS16 and C-functional gene OsMADS3, which are related to flower organ development, were significantly decreased, while the transcription level of A-function gene RAPIA was not affected.
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