【摘 要】
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水杉(Metase quoia glyptostroboides)是中国著名的一级保护植物,素有“活化石”之称.为了更好地保护和利用这一重要种质资源,本研究以水杉为实验材料,在全长转录组测序的基
【机 构】
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西华师范大学,西南野生动植物资源保护教育部重点实验室,南充,637002;西华师范大学生命科学学院,南充,637002
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水杉(Metase quoia glyptostroboides)是中国著名的一级保护植物,素有“活化石”之称.为了更好地保护和利用这一重要种质资源,本研究以水杉为实验材料,在全长转录组测序的基础上,利用四个软件对61 057个Unigenes进行了蛋白编码潜能预测,最终获得3 385个长链非编码RNA (long non-coding RNAs,lncRNAs)分子.进一步对这些lncRNAs的长度和数量作统计分析,结果显示,最短为200 nt,最长为11 134nt,平均长度为1 956 nt;大部分lncRNAs的长度介于200～2 000 nt,占总量的59.5％;在2 001～4 000 nt的长度范围内,也发现较多的lncRNAs,达到总量的32.2％;在长度为4 001～6 000 nt的范围内,只有7.6％;长度超过6 000 nt的lncRNAs很少,总共只有25个(占总量的0.7％).本研究结果为水杉资源的保护和利用研究提供了一些分子依据,为其它植物在相关领域的研究提供了一些参考.
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