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复旦大学附属儿科医院专业设置齐全，是上海市第一家小儿涉外特需医疗中心和亚洲国际救援中心。呼吸急救专业是上海市医学领先专业重点学科，小儿外科是上海市小儿外科疑难重症诊治中心，还设有上海市性早熟中医特色门诊。医院共有39个临床和医技科室，主要专业涉及儿内科（新生儿、呼吸、消化、血液、肾脏、神经、内分泌、免疫、遗传等）、儿外科（普外、泌尿、骨科、