利用高通量测序平台研究非小细胞肺癌（NSCLC）热点基因突变情况，系统性分析突变位点的分布、类型以及频度，评估突变位点致病性。
方法本研究共纳入94例NSCLC组织样本，均为2015年7月至2017年4月在山东大学齐鲁医院胸外科收集的非小细胞肺癌（NSCLC）石蜡包埋（FFPE）和新鲜组织样本。患者年龄在35~82岁之间，年龄中位数是61岁。男性63例，女性31例。选择22个基因：KRAS、EGFR、BRAF、PIK3CA、AKT1、ERBB2、PTEN、NRAS、STK11、MAP2K1、ALK、DDR2、CTNNB1、MET、TP53、SMAD4、FBXW7、FGFR3、NOTCH1、ERBB4、FGFR1和FGFR2。用Thermo fisher公司Ion Torrent测序平台的Ion Ampli Seq Colon and Lung Cancer Panel进行测序。Ion Torrent平台测序数据使用Ion torrent suite v4.4.2软件进行分析。
结果在NSCLC常见的22个突变基因中，TP53基因突变频率最高，约占所有突变的46.9%，其次是EGFR基因（占28.1%）；共检测出89种突变，包括63种热点突变（已报道的位点）和26种新发突变（未见报道的位点），其中检出频率最高的是EGFR基因的19号外显子缺失突变，其次是EGFR基因的Leu858Arg；分析EGFR基因的靶向用药位点的突变情况，结果显示EGFR的19号外显子的缺失突变检出次数最高，其次是21号外显子L858R突变；利用生物信息学软件分析了26种新发突变的致病性，结果显示除ATK1：c.47-12G>A和TP53：c.214C>G这两个位点以外，剩余的24种新发突变位点在基因保守性、氨基酸序列变化、蛋白结构影响三个方面至少有一项会对基因的功能产生重大影响。
结论本研究通过NGS对NSCLC多个敏感基因的突变位点进行联合检测，更能全面覆盖基因变异情况，为筛选最适宜靶向治疗的群体提供依据。新发突变的致病性预测以及所涉及的肿瘤相关信号通路的改变，为后续为进一步研究NSCLC致病机制提供参考。