利用GBS-cpDNA揭示花生属花生区组内种间亲缘关系

• 作 者: 李春娟 闫彩霞 石程仁 赵小波 王娟 单世华
• 机 构: 山东省花生研究所
• 出 处: 花生学报
• 发表日期: 2018年1期
• 关键词: GBS-cpDNA 花生 亲缘关系 系统树 GBS-cpDNApeanutgenetic relationshipphylogenetic tree
• 基金项目: 国家科技支撑计划项目(2014BAD11B04),山东省自然科学基金博士基金(ZR2017BC082),中央引导地方科技发展专项资金,花生抗逆、广适种质资源创新与利用(山东省农业良种工程),山东省现代农业产业技术体系花生遗传育种岗位(SDAIT-04-02)

揭示栽培种花生(Arachis hypogaea L.)与同属花生区组野生种之间的亲缘关系可为野生资源引入和遗传资源保存提供重要参考。本研究基于已公布的栽培种花生叶绿体全基因组序列,以11份花生区组的野生种资源和44份不同类型的栽培种花生为研究材料,利用GBS(Genotyping-by Sequencing)测序结果中能够比对到叶绿体全基因组的序列信息,获得了叶绿体基因组上111个SNP位点和10个InDel位点。根据系统演化树以及主成分判别分析结果显示:与栽培种花生关系最近的野生种是A.montico