【摘 要】
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生物元件库是对元件数据和实物进行收集、整理和共享的重要平台,对合成生物学的研究和应用具有非常重要的支撑作用.本文对国内外生物元件库的研究进展进行了介绍和综述.国外先后出现了标准生物元件登记库等多个元件库,通过制定OpenMTA协议实现了元件实物的免费分发共享,并通过制定“合成生物学开放语言”(SBOL)实现了多个元件库之间的数据交换;通过bionet项目对元件数据和实物的去中心化管理作了进一步尝试.近年来我们与国内多家科研单位合作建设了合成生物学元件与数据库(RDBSB,https://www.biosi
【机 构】
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中国科学院计算生物学重点实验室,生物医学大数据中心,中国科学院上海营养与健康研究所,上海200031;中国科学院分子植物科学卓越创新中心,合成生物学重点实验室,上海200032
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生物元件库是对元件数据和实物进行收集、整理和共享的重要平台,对合成生物学的研究和应用具有非常重要的支撑作用.本文对国内外生物元件库的研究进展进行了介绍和综述.国外先后出现了标准生物元件登记库等多个元件库,通过制定OpenMTA协议实现了元件实物的免费分发共享,并通过制定“合成生物学开放语言”(SBOL)实现了多个元件库之间的数据交换;通过bionet项目对元件数据和实物的去中心化管理作了进一步尝试.近年来我们与国内多家科研单位合作建设了合成生物学元件与数据库(RDBSB,https://www.biosino.org/rdbsb/or https://www.biosino.org/npbiosys/).在建设过程中,我们首先建立了与SBOL语言兼容的《催化元件数据标准》、多种重要元件的标准功能测试方法以及安全高效的元件提交系统,并在此基础上完成了元件数量最多且信息最为全面的催化元件数据库的构建.目前,收集了30多万个催化元件,包括7万多个具有文献支持功能表征信息的催化元件,并保藏了1万个以上的实物元件和5000个底盘菌株,通过网站实现了数据和实物的公开与共享.上述元件库已经对国内合成生物学的研究和应用产生了积极地推动作用,访问量超过100万次/年,提供元件和底盘共享服务大于100次/年,并为多家企业和研究单位提供了元件和底盘的定制服务.虽然我们的元件库建设取得了巨大的进步,但是仍需在调控元件的收集整理和共享机制创新等方面取得更多的突破,在数据有源、多层审核、资源共享、信息公开、信息安全和授权访问的基础上,加速生物元件数据、实物和设计工具的汇聚,并进一步服务合成生物学研究.
其他文献
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研究了磁体与运动导体之间的相互作用,运用自制的仪器,对磁悬浮力、磁阻尼力以及感应磁场的磁感应强度等物理量进行了测量,并利用双梁力传感器对磁体前后两侧的受力进行了同步测量,观察到了两侧作用力的变化行为.通过对涡流与磁场相互作用过程的分析,建立了用迭代过程描述的理论模型,得到感应磁场的方向随角速度增加发生旋转的结论,并导出了这些量与导体转动角速度之间的关系式.
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建立了预制混凝土管组合柱-钢梁节点在往复荷载作用下受力性能分析的精细化有限元计算模型.根据已完成的6个“弱节点”试验结果,对比分析试验与模拟试件的破坏模式、梁端荷载-位移骨架曲线和特征点荷载,验证了有限元模型的准确性.研究了预制混凝土管组合柱-钢梁节点核心区受力全过程工作机理,并对各关键组件的应力、应变发展规律及其相互作用进行分析.通过有限元模型参数化分析,研究了轴压比、钢套箍厚度、钢套箍延伸高度、预制混凝土管强度及芯部混凝土强度等因素对节点承载力和变形能力的影响.分析结果表明:在梁端往复荷载作用下,钢套
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介绍了第7届全国大学生物理实验竞赛综合研究性实验试题C的实验原理、试题内容及答案,并对参赛学生的考试结果进行了评析.综合研究性实验试题C为基于给定条件搭建黑箱光路,包括3部分:晶体偏振光学元件的识别,光传输路径的控制,探究偏振在光测弹性应力测试中的应用.试题突出了理论分析与实验技能相结合,考察学生知识积累、知识获取、方案设计、系统搭建、结果分析的综合实验能力.
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