【摘 要】
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对猪全基因组高密度SNP基因型数据及生长性状表型数据进行全基因组关联分析,以期找到影响这些性状的候选基因,更准确地了解这些生长性状的遗传基础。利用Illumina猪60K SNP芯
【基金项目】
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国家现代农业(生猪)产业技术体系建设专项资金(CARS-36);国家自然科学基金(31200925);教育部博士点基金(20124404120001);广东省自然科学基金(S2012040007753);广州市科技攻关项目(11A62100441);广东省研究生教育创新计划项目(2013JDXM12)
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对猪全基因组高密度SNP基因型数据及生长性状表型数据进行全基因组关联分析,以期找到影响这些性状的候选基因,更准确地了解这些生长性状的遗传基础。利用Illumina猪60K SNP芯片对191头杜洛克猪进行基因型检测,使用R语言环境下GenABEL软件包提供的单标记回归分析模型,对体重达100 kg日龄(D100)、活体背膘厚(BFT)和活体眼肌面积(LMA)3个生长性状的表型分别进行全基因组关联分析。在D100和LMA2个性状中分别检测到1个基因组水平和6个染色体水平显著关联的SNP,均位于5号染色体;没有检测到与BFT显著相关的SNP。生物信息学分析表明,BTG1和EFCAB6可能是影响生长性状的重要候选基因,但其功能有待进一步研究确认。
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