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基于微生物16SrRNA基因的高通量测序技术发展迅速,对该基因序列数据进行微生物操作分类单元(Operational Taxonomic Units,OTU)聚类的研究,产生了大量的微生物群落聚类算法和软件分析工具。为了更精确地识别微生物物种,从聚类方法、算法应用和当前存在的问题三个方面详细阐述目前的OTU聚类情况,OTU聚类算法应用主要体现在软件包工具和生物研究领域中,并综合最新的研究成果提出目前未解决的问题。