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四川省历史上曾有疑似鼠疫发生,疑似疫源地位于西北部的甘孜、阿坝州,是中国喜玛拉雅旱獭(简称旱獭)鼠疫自然疫源地的延伸部分,上世纪80年代,在甘孜、阿坝州8个疑似疫源县进行的以血清学、病原学为主的多次流行病学调查和监测,仅有指示动物和宿主动物血清为阳性;直到1997年在甘孜州石渠县分离出鼠疫杆菌,才证实了四川鼠疫自然疫源地的存在.