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推进县级公立医院综合改革是坚持公立医院的政府主导方向，增强县级医院的公益职能，落实国家基本药物管理制度，维护人民群众健康权益，体现“保基本、强基层、建机制”的内在要求。但改革面临诸多困难和问题，主要是财政投入不到位、财力供需矛盾突出、债务负担沉重、监管部门执行政策效能不高、内控制度不完善等。对上述问题探讨分析，提出对策建议，以促进医改工作顺利开展，确保改革取得实效。