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为了对轨道交通规划方案进行定量评比，建立了轨道交通规划方案的安全（S）、效能（E）和成本（C）指标体系，评价过程中，对SEC指标体系中定性和定量的指标分别采用专家评判和隶属度函数两种方式进行处理，尽量保证指标的真实性，并建立基于模糊层次分析法轨道交通规划方案评估模型，运用方根法对指标进行排序，实现轨道交通方案的评选与决策。最后以某市轨道交通不同规划方案为例，验证了该指标体系和方法的合理性，为轨道交通规划方案的决策提供了理论依据。