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在改革开放的春风中，西藏藏医学院于1989年独立建院。建院初期，仅有的25名教师大部分来源于西藏大学藏医系和自治区藏医学校；自治区卫生厅又从全区藏医药系统调整了一批理论水平较高、具有临床经验的医务工作者充实到教师队伍中。由于藏医药专业的特殊性，藏医药专业教师无法从其他高校或其他渠道引进，只能以学院自己培养为主。