香蕉苯丙氨酸解氨酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析

• 作 者: 杨会晓 孙媛媛 贾彩红 金志强 徐碧玉 王卓
• 机 构: 中国热带农业科学院热带生物技术研究所/农业农村部热带生物技术重点实验室,南京农业大学园艺学院
• 出 处: 热带作物学报
• 发表日期: 2019年10期
• 关键词: 香蕉 苯丙氨酸解氨酶 系统进化分析 表达分析 基因家族
• 基金项目: 国家自然科学基金(No.31501624);海南省自然科学基金资助项目(No.318MS090);现代农业产业技术体系(No.CARS-32)

苯丙氨酸解氨酶(Phenylalanine ammonia-lyase,PAL)是催化苯丙烷代谢途径第1步反应的限速酶,广泛地参与植物生长发育过程中的各种生理活动。本研究通过生物信息学分析,从香蕉A基因组数据库中利用BLASTp筛选出53个可能的MaPAL编码蛋白序列。在NCBI分析蛋白保守结构域,发现仅有8个基因具有典型的PAL家族基因的特性。聚类分析结果表明香蕉MaPAL家族的8个基因可以分为Class I和Class II两类。转录组数据表明,所有MaPAL基因在果实发育阶段高表达,MaPAL5参与