【摘 要】
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目的 采用生物信息学方法预测羊种布鲁氏菌BP26蛋白的抗原表位.方法 从NCBI数据库中获取羊布鲁氏菌的BP26蛋白的氨基酸序列,利用ExPASy蛋白分析在线软件ProtParam、SOPMA、SW
【机 构】
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黔西南民族职业技术学院生物工程系,贵州兴义562400;六盘水师范学院生物科学与技术学院;石河子大学动物科技学院人兽共患病实验室
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目的 采用生物信息学方法预测羊种布鲁氏菌BP26蛋白的抗原表位.方法 从NCBI数据库中获取羊布鲁氏菌的BP26蛋白的氨基酸序列,利用ExPASy蛋白分析在线软件ProtParam、SOPMA、SWISS MODEL,ProtScale、Signal 5.O、TMHMM2.0、PSOTR,分析BP26蛋白的理化性质,二、三级结构,亲、疏水性,信号肽,跨膜区及亚细胞定位;使用IEDB分析BP26蛋白的B细胞表位;使用PROSITE SCAN分别BP26蛋白的结构域分析.结果 BP26蛋白由250个氨基酸组成,分子式为C1152H1898 N328O364S12,相对分子质量为26.5×103,理论等电点为6.39,不稳定系数为27.93,为稳定蛋白.二级结构以α-螺旋为主,占41.2％;无规卷曲占36.8％,延伸链占17.2％;β-转角占4.8％.预测其三级结构与同源模板S19株BP26蛋白相似性99.55％,16个BP26分子形成一个新颖的通道状结构.BP26蛋白存在1个跨膜区,该跨膜区域位于7-29位氨基酸,可能为信号肽,与信号肽分析结果一致.Signal 5.0分析BP26蛋白在7-29位氨基酸有一个分泌型蛋白信号肽.BP26蛋白包含有14个线性表位,其中以27-42、108-125,224-240位氨基酸区段为BP26蛋白的优势抗原表位区段.BP26蛋白包含2个N-糖基化位点,2个蛋白激酶C磷酸化作用位点,2个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化作用位点,5个N-豆蔻酰基化位点;亚细胞定位分析BP26蛋白为膜周质蛋白.结论 生物信息学分析羊种布鲁氏菌BP26蛋白存在多个B细胞抗原表位,可以作为布鲁氏菌诊断和疫苗研究的候选抗原.
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