【摘 要】
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目的 构建miRNA-mRNA网络,预测哮喘的治疗靶点和潜在的治疗药物.方法 从基因表达综合数据库(GEO)下载2个数据集,用edgeR进行基因表达差异分析.差异miRNAs的靶点由miRTarBase
【机 构】
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云南省第二人民医院、昆明医科大学 第四附属医院 呼吸与危重症医学科,云南 昆明650021;昆明医科大学 第一附属医院 呼吸与危重症医学科,云南 昆明650032
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目的 构建miRNA-mRNA网络,预测哮喘的治疗靶点和潜在的治疗药物.方法 从基因表达综合数据库(GEO)下载2个数据集,用edgeR进行基因表达差异分析.差异miRNAs的靶点由miRTarBase、miRDB和TargetScan预测,通过cytoscape构建miRNA-mRNA网络.基于Metascape进行功能富集,cMAP用于预测小分子药物.结果 筛选出118个差异mRNAs和16个差异miRNAs.在miRNA-mRNA网络中,miR-101-3p、miR-96-5p和miR-429可能成为哮喘的治疗靶点.功能富集发现差异mRNAs主要与免疫应答、炎症反应、MAPK级联调节和TGF-beta信号通路等有关.此外,我们发现了5种哮喘的潜在治疗药物.结论 成功构建miRNA-mRNA网络,miR-101-3p、miR-96-5p和miR-429均可能为治疗靶点,并预测了5种哮喘的潜在治疗药物.
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