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环境影响评价和排污许可制度都是保护环境质量、维护自然生态的重要的准则制度。二者主要侧重的重点不同,环境影响评价主要是评价人类活动对于其活动地区的环境质量的影响;排污许可制度则是更加偏向对于污染源的管理和控制,进而从源头上消除污染排放。从目标功能上看,两种制度都是为了实现保护环境这一目标,因此应该将二者有机的结合,更好的服务于环境保护。