miR-4472的靶基因预测及生物信息学分析

• 作 者: 刘珏 陈星光 朱雯 侯秋英 张旭 沈方方 滕懿群
• 机 构: 嘉兴市第二医院儿科、嘉兴市儿童医学中心,嘉兴市第二医院小儿骨科
• 出 处: 浙江医学
• 发表日期: 2020年13期
• 关键词: 新生儿缺氧缺血性脑病 miR-4472 靶基因 信号通路 生物信息学 Hypoxic-ischemic encephalopathymiR-4472Target
• 基金项目: 浙江省自然科学基金一般项目(LY18H040014),浙江省科技计划项目(2013C33218)

目的应用生物信息学分析方法预测miR-4472的靶基因及信号通路。方法利用miRBase数据库分析miR-4472的物种保守性;利用Targetscan、miRDB数据库进行靶基因预测,再用DAVID数据库将miR-4472的预测靶基因集合进行基因本体(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)生物通路富集分析。结果miR-4472预测的交集靶基因共378个。GO分析结果显示,miR-4472的靶基因主要参与转录的正负调节、细胞凋亡、蛋白质磷酸化等生物过程(均P<0.01)。KEGG信