【摘 要】
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目的:归纳分析胃癌易感基因的相关文献,并进行生物信息学分析,为进一步的研究提供参考依据。方法:检索Pub Med、Embase、中国知网数据库、万方数据库2006年1月1日至2015年12
【机 构】
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甘肃中医药大学甘肃省高校重大疾病分子医学与中医药防治研究省级重点实验室; 敦煌医学与转化省部共建教育部重点实验室;
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(No.81660744)~~
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目的:归纳分析胃癌易感基因的相关文献,并进行生物信息学分析,为进一步的研究提供参考依据。方法:检索Pub Med、Embase、中国知网数据库、万方数据库2006年1月1日至2015年12月31日发表的文献,摘录胃癌易感基因并进行GO分类、KEGG通路分析、在线STRING 9.05软件构建蛋白-蛋白相互作用网络图、Cytoscape2.8.2软件可视化分析。结果:共检索有效文献405篇,摘录胃癌相关易感基因188个,不同分级的GO分类201种,KEGG通路13种,这些基因主要与细胞损伤修复、免疫反应、细胞周期调节、炎性反应、DNA损伤修复、凋亡和抗原递呈等有关。KEGG通路主要是参与细胞因子-细胞因子受体相互作用、细胞凋亡、Toll样受体信号通路、谷胱甘肽代谢、MAPK信号转导通路、脂肪酸代谢等。其中178个可翻译成蛋白的蛋白与蛋白相互作用网络图,提示这些基因的表达产物大部分存在密切的相互关系。进一步可视化及量化,筛选出TP53、VEGF-α、SOD2、TNF、STAT3、BRCA1、PTGS2、PTEN、TGF-β1 9个基因蛋白网络节点度数超过30。结论:TP53、VEGF-α、SOD2、TNF、STAT3、BRCA1、PTGS2、PTEN、TGF-β1 9个基因可能为胃癌易感关键基因。
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