栽培花生Aux/IAA家族鉴定与生物信息学分析

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Aux/IAA (Auxin/Indole-3-Acetic Acid)家族是生长素(Auxin)信号的早期响应基因家族之一,广泛参与调控植物的生长发育.然而目前对于栽培花生(Arachis hypogaea) Aux/IAA家族的研究还未见相关报道.本研究在栽培花生中共鉴定到了34个Aux/IAA基因,分布在15条不同的染色上.多重序列比对分析发现花生Aux/IAAs具有4个保守结构域,分别为Ⅰ-Ⅳ.聚类分析将花生Aux/IAAs分为Ⅰ-Ⅷ,8个亚家族.各个亚家族内部基因具有相似的保守基序,而基因之间的内含子/外显子结构存在差异.基于基因表达模式分析将栽培花生分为A和B两组基因,A组基因在花生各个组织的表达量都相对较高,而B组基因的表达具有组织特异性.基于以上结果,本研究将为进一步对Aux/IAA家族的基因功能研究提供科学依据.
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