【摘 要】
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目的:通过分析肺鳞癌及癌旁组织差异表达基因,初步筛选潜在生物标志物。方法:从公共基因表达数据库(GEO)下载肺鳞癌的芯片数据集。利用R语言limma包对原始数据进行预处理并筛
【机 构】
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内蒙古医科大学内蒙古自治区分子生物学重点实验室
【基金项目】
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国家自然科学基金(81871252、81660272、81460248),内蒙古自治区自然科学基金(2017ZD08、2016MS0318、2016MS0368),内蒙古医科大学青年创新基金项目(YKD2017QNCX034)资助
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目的:通过分析肺鳞癌及癌旁组织差异表达基因,初步筛选潜在生物标志物。方法:从公共基因表达数据库(GEO)下载肺鳞癌的芯片数据集。利用R语言limma包对原始数据进行预处理并筛选差异表达基因,通过R语言的cluster-Profiler包对差异表达基因进行GO和KEGG分析。利用STRING在线软件分析差异基因表达蛋白之间的相互作用,并通过Cytoscape筛选关键基因,进而用GEPIA在线软件验证关键基因的表达情况。结果:通过分析共得到734个差异表达基因,其中290个基因在肺鳞癌中上调,444个基因下调
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