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学科是现代大学，尤其是研究型和教学研究型大学的基层组织和核心，因此需要建立基于学科发展的现代大学经费分配和预算管理新机制。这一新机制应遵循“一切以为学科发展服务”的新理念，形成“学校-学院-学科”的二级机构三级模式，并按照新机制下的程序进行经费的分配及预算，从而达到事权、财权的统一，加强学科的组织化，并提高资金的使用效率。