花生14-3-3基因家族的生物信息学分析

• 作 者: 姜焕焕 王通 禹山林 陈明娜 王冕 陈娜 潘丽娟 祁佩时 迟
• 机 构: 山东省花生研究所,哈尔滨工业大学环境学院
• 出 处: 中国油料作物学报
• 发表日期: 2018年4期
• 关键词: 花生 14-3-3蛋白 生物信息学分析 逆境胁迫 peanut 14-3-3 gene family bioinformatic stress resistan
• 基金项目: 2014年国家“万人计划”青年拔尖人才(W02070268),国家花生产业技术体系(CARS-13),国家自然科学基金(31701464),山东省自然科学基金(ZR2014YL011,ZR2014YL012,ZR2017YL017),山东省农业科学院青年科研基金(2016YQN14),山东省农业科学院青年英才培养计划,山东省农业科学院农业科技创新工程(CXGC2016B02,CXGC2018E21

14-3-3是一类广泛存在于真核生物细胞内的多基因家族蛋白,在植物信号传导、生长发育及抗逆胁迫反应中发挥重要作用。本文通过隐马尔柯夫模型(hidden Markovmodel,HMM),对野生花生(Arachis ditranensis和Arachis ipaenis)基因组的蛋白质数据库进行搜索,获得Adl4-3-3基因家族成员14个,Ail4-3-3基因家族成员13个。进化树分析显示其主要分为ε类和非ε类,其中Adl4-3-3家族包含6个ε类和8个非ε类;Ail4-3-3家族包含了7个ε类和6个非ε类