【摘 要】
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以纹枯病菌AG1-IA(Rhizoctonia solani)诱导玉米高耐纹枯病自交系R15,采用cDNA-AFLP技术分析其基因差异表达谱。在拔节期对R15幼苗进行接菌处理,12、24、36、48、60 h分别取
【机 构】
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四川农业大学玉米研究所,四川农业大学生命科学与理学院,
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以纹枯病菌AG1-IA(Rhizoctonia solani)诱导玉米高耐纹枯病自交系R15,采用cDNA-AFLP技术分析其基因差异表达谱。在拔节期对R15幼苗进行接菌处理,12、24、36、48、60 h分别取材,以不接菌为对照。用56对AFLP选扩增引物对处理和对照的cDNA进行AFLP分析,得到87个差异片段,回收并剔除假阳性,克隆获得18条阳性差异条带(TDFs)。BLASTn比对结果表明,其中可以找到同源序列的有13个TDFs,按其功能可分为信号传导(2个)、抗病与防御基因(2个)、转录调控(2个)、能量代谢(2个)等。对13个TDFs基因进行了半定量RT-PCR分析,结果表明13个差异片段在对照与处理,或是处理的不同时段存在着表达量的差异。
Rhizoctonia solani (Rhizoctonia solani) was used to induce Rhizoctonia solani inbred line R15. The differential expression profiles of these genes were analyzed by cDNA-AFLP. The R15 seedlings were inoculated at the jointing stage and harvested at 12, 24, 36, 48, and 60 h respectively. Fifty-eight AFLP fragments were obtained by AFLP analysis of 56 pairs of AFLP amplified primer pairs. A total of 87 differential fragments were obtained, and the false positives were recovered and cloned to obtain 18 positive differential bands (TDFs). The results of BLASTn alignment showed that there are 13 TDFs in which homologous sequences can be found, which can be divided into two types by signal transduction (2), resistance and defense genes (2), transcriptional regulation (2), energy metabolism (2) and so on. The 13 TDFs genes were analyzed by semi-quantitative RT-PCR. The results showed that there were differences in the expression levels of 13 different fragments between control and treatment, or at different time points.
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