我国肠道病毒71型（EV71）疫苗株生物信息学分析

• 作 者: 吴星 张军楠 姚昕 毛群颖 高帆 王一平 梁争论
• 机 构: 中国食品药品检定研究院
• 出 处: 中国药事
• 发表日期: 2013年11期
• 关键词: 肠道病毒71型 疫苗 病毒株 生物信息学 EV71 vaccine virus strains bioinformatics
• 基金项目: 国家＂十二五＂科技重大专项课题（编号2012ZX10004701）

目的 比较3个EV71疫苗株病毒的生物信息学特点,为疫苗的质控和探讨该病毒疫苗的免疫机制提供参考.方法 本研究利用DNAstar MegAlign、DNAMAN Alignment、ANtheProt等生物学软件,比较了我国已进入临床试验的3家EV71全病毒灭活疫苗毒株的基因组及氨基酸序列,并对英衣壳蛋白二级结构及可能存在的抗原表位进行了预测分析.结果 3个疫苗株病毒基因同源性为97％～99％；氨基酸同源性为98％～99％；二级结构一致率在95％以上；均存在35个潜在抗原表位区域.结论 3个疫苗株生物信息