原核生物基因组的CDS与ORF序列的几点分析

• 作 者: 沈世镒 高建召 胡刚 王奎
• 机 构: 南开大学数学科学学院与LPMC
• 出 处: 生物数学学报
• 发表日期: 2009年1期
• 关键词: 基因组的p_0-MORF序列 MORF生成算法 CDS与ORF序列集合的相互关系 p0-MORF sequence MORF algorithm Relat
• 基金项目: 天津大学、南开大学联合研究项目,刘徽应用数学研究中心与国家自然科学基金（10271061,90208022）资助

基因组的开放阅读框（ORF）是基因识别与基因组分析的基础,有多种软件包给出了它们的生成算法,但结果与指标并不统一.本文给出了po-MORF的定义与它的生成算法,证明了由基因组所确定的po-MORF集合的存在与唯一性,并由该生成算法可以得到全部po-MORF序列.我们还比较了若干原核生物基因组中所有CDS与po-MORF序列的相互关系,并讨论了关于基因识别中的有关问题.