【摘 要】
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目的:探究患枯萎病菊花与健康菊花根际土壤微生物群落的差异.方法:以患病菊花植株和健康菊花植株根际土壤为研究材料,采用高通量测序技术对患病植株和健康植株样本的细菌16S
【机 构】
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湖北中医药大学药学院,武汉430065;中国中医科学院中药资源中心,北京100700;湖北中医药大学药学院,武汉430065;中国中医科学院中药资源中心,北京100700
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目的:探究患枯萎病菊花与健康菊花根际土壤微生物群落的差异.方法:以患病菊花植株和健康菊花植株根际土壤为研究材料,采用高通量测序技术对患病植株和健康植株样本的细菌16S rDNA和真菌内部转录间隔区(ITS)基因进行序列测定并进行数据分析.结果:枯萎病的发生降低了菊花根际土壤中细菌种群的丰富度和多样性程度,但对根际土壤中的真菌α-多样性无明显影响.菊花健康植株根际土壤细菌微生物中酸杆菌门、芽单胞菌门、硝化螺旋菌门占比高于患病植株,而变形菌门、拟杆菌门占比低于患病植株(P＜0.05).菊花患病植株根际土壤中镰刀菌属(Fusarium)真菌占比分别为27.49％,14.53％,11.94％,而健康植株镰刀菌属真菌占比分别为0.47％,1.01％,0.67％.菊花患病植株根际土壤中会出现细菌性致病菌果胶杆菌属(Pectobacterium)和菊迪基氏菌属(Dickeya),而健康植株根际土壤中硝化类细菌、解毒类细菌、光合细菌等丰度高于患病植株.结论:患有枯萎病地块菊花植株根际土壤微生物中细菌的物种多样性和丰富度降低,并大量富集镰刀菌属致病真菌和积累果胶杆菌属与菊迪基氏菌属致病细菌,而健康菊花植株根际土壤微生物有益菌占比明显高于患病植株.
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