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中医学以间接致思的思维方式探求人体生理、病理及防病治病规律，开展方证研究也应遵循中医学的本原思维模式。方随证出，因证变化而药物组成变化是方证对应的一般规律，称之为“方证相对论”。方证对应理论体系是非线性的、多维的、开放的复杂系统，其研究内容应体现当代医学最新成就。从中药分子水平开展方剂配伍规律研究，阐明方剂作用机理以求得方证的最佳对应和变化规律，应是方证研究深化的客观要求和关键所在。