枣抑制消减cDNA文库构建与分析

• 作 者: 魏琦琦 段经华 冯延芝 李芳东 张琳
• 机 构: 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室,中南林业科技大学经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室,中南林业科技大学经济林培育与利用湖南省2011协同创新中心,中国林业科学研究院经济林研究
• 出 处: 经济林研究
• 发表日期: 2016年4期
• 关键词: 枣 抑制消减杂交 CDNA文库 生物信息学分析 功能注释 Ziziphusjujube suppression subtractive hybridizati

枣树具有独特的开花结果特性，为获得枣花发育基因，以金丝4号枣不同发育时期的花蕾和同时期的叶片cDNA互为试验方和驱动方，利用抑制消减杂交技术分别构建了枣花和枣叶抑制消减杂交cDNA文库（SSH文库）。枣花和枣叶SSH文库重组率分别是92．05％和90．26％，插入片段长度均介于200～2000bp之间，主要集中于1000bp左右。分别从枣花和枣叶SSH文库中随机挑选1000个阳性克隆进行DNA测序、组装拼接，结果显示枣花SSH文库中获得96条unigene，其中contigs43个，singletons5