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污染源氨氮在线自动监测仪已在我国水质自动监测系统中得到广泛应用，在线自动监测技术日趋成熟，但在比对监测过程中，发现该仪器仍有许多问题需要进一步认识与改进。对在线仪器设备比对分析过程中遇到的问题进行了总结，为进一步规范污染源自动监控数据的管理，切实体现污染源自动监控数据法律地位，确保自动监控数据准确、有效。