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会计集中核算制度是指在单位资金所有权、使用权和财务自主权不变的原则下，资金使用权和管理权相分离，会计核算中心集中办理资金结算、集中进行会计核算、集中管理会计档案的一种融会计核算、监督、服务于一体的会计管理模式。2002年8月我市成立了诸暨市预算会计核算中心卫生分中心（以下简称卫生分中心），同年9月起正式对医疗卫生单位实行会计集中核算。在这一制度下，医院资金载体发生了变化，由此导致各项内部审计工作的对象、目标、重点、方式方法等都相应发生了变化。