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补体系统由复杂的血浆蛋白质构成，为体液免疫系统的固有部分，其活化引起一系列的级联反应，最终产生多种促炎分子。该系统亦含有活化过程中产生的补体片段和调控分子的受体。在AS病变形成过程中有两种突出的细胞现象：单核细胞募集（之后形成泡沫细胞）和平滑肌细胞活化。内皮下LDL的沉积为上述事件的重要刺激。大量的证据表明，补体活化可能为脂蛋白沉积和之后病变的形成之间的桥梁。