【摘 要】
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目的 筛选结直肠癌与正常大肠组织差异表达基因并分析其与预后的关系.方法 通过基因表达综合数据库(GEO)下载结直肠癌基因芯片GSE110224、GSE41328、GSE22598.利用R软件4.0.3筛选结直肠癌组织与正常组织差异表达基因,对这些基因进行GO和KEGG分析;使用STRING数据库构建PPI网络并将结果导入Cytoscape v3.7.2筛选出枢纽基因,最后通过GEPIA数据库验证其差异表达情况及与患者预后关系.结果 筛选出366个差异表达基因,其中128个上调,238个下调.GO分析结果表
【机 构】
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230601 合肥,安徽医科大学第二临床医学院;230012 合肥,安徽中医药大学药学院;230032 合肥,安徽医科大学基础医学院生理学教研室
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目的 筛选结直肠癌与正常大肠组织差异表达基因并分析其与预后的关系.方法 通过基因表达综合数据库(GEO)下载结直肠癌基因芯片GSE110224、GSE41328、GSE22598.利用R软件4.0.3筛选结直肠癌组织与正常组织差异表达基因,对这些基因进行GO和KEGG分析;使用STRING数据库构建PPI网络并将结果导入Cytoscape v3.7.2筛选出枢纽基因,最后通过GEPIA数据库验证其差异表达情况及与患者预后关系.结果 筛选出366个差异表达基因,其中128个上调,238个下调.GO分析结果表明差异表达基因主要涉及蛋白水解、细胞增殖的正性调节等生物学过程;富集于细胞外间隙、胞外区等细胞成分;介导锌离子结合、钙离子结合等分子功能.KEGG分析显示差异表达基因主要富集于细胞因子受体相互作用、趋化因子信号通路等相关信号通路.从PPI网络中筛选出10个枢纽基因分别为CXCL8、CXCL1、SPP1、CXCL12、COL1A1、SOX9、MMP3、COL1A2、CD44、CXCL5.使用GEPIA网站验证发现差异趋势均一致,其中8个有显著性差异.预后分析显示CXCL8、SPP1和COL1A2与结直肠癌患者生存率有关.结论 CXCL8和SPP1为结直肠癌患者预后关键基因,可考虑作为潜在生物标志物为结直肠癌筛查和诊治提供分子学依据.
其他文献
目的 探讨经自然腔道取标本手术(NOSES)在3D腹腔镜直肠癌超低位前切除术中的安全性、有效性.方法 回顾性分析2018年1月至2020年12月期间同济大学附属上海东方医院胃肠肛肠外科接受3D腹腔镜直肠癌超低位前切除术患者80例的临床资料,根据手术方式不同分为两组:术中经自然腔道取标本手术组(NOSES组)34例;传统腹腔镜腹部辅助切口手术组(传统组)46例,两组均行预防性末端回肠造口术,比较两组的手术安全性及近期疗效.结果 两组资料在年龄、性别、身体质量指数、肿瘤直径、肿瘤部位、肿瘤分期比较,差异均无统
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经自然腔道取标本手术越来越多地被应用到腹腔镜结直肠癌手术中.右半结肠由于距肛门较远、标本体积较大,经自然腔道取出标本具有一定困难.目前已有的经阴道或直肠取出标本的方法需额外切口,造成一定的创伤.本文介绍一例右半结肠癌根治NOSES术经横结肠腔道标本取出病例.
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疼痛是肛肠疾病术后最常见的并发症之一,现代研究表明阿片类药物对于中重度疼痛的缓解有着不可替代的作用,但是由于其成瘾性受到严格管控.对于肛肠术后疼痛,阿片类药物在应用规范方面存在很大争议,本文就国内外肛肠术后阿片类药物的应用展开综述,希望能对临床规范化使用阿片类药物有所启发.
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