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１９８４—１９９１年的调查研究结果表明，福建烟区的烟草病毒有ＴＭＶ－Ｃ，Ｔｏｍ，ＹＭ和ＲＳ株系，ＣＭＶ－Ｃ，Ｙｅｌ和ＴＮ株系，以及ＴＥＶ，ＴＬＣＶ，ＴＲＶ，ＴＲＳＶ，ＴＳＶ，ＴＶＢＭＶ，ＴｏＡＶ，ＴｏＢＲＶ，ＰＶＸ，ＰＶＹ，其中以ＣＭＶ－Ｃ和ＴＭＶ－Ｃ为优势株系，分别占样品总数的２７．８％和２７．７％。各种病毒（株系）及其发生的频率因地区和年份而有所不同。在田间各种病毒（株系）的株发病率因烟草品种、烟苗来原和前作类型不同而有差异。