Analysis of EST-SSRs in silver birch（Betula pendula Roth.）

• 作 者: Ertugrul Filiz Ilhan Dogan Ibr
• 机 构: DepartmentofCropandAnimalProduction,DepartmentofMolecularBiologyandGenetics,DepartmentofBiology,Depa
• 出 处: 林业研究：英文版
• 发表日期: 2016年3期
• 关键词: EST-SSRS 白桦 简单重复序列 EST序列 银桦 表达序列标签 软件设计 核基因组 Silver birch （Betula pendula） Bet

定义为顺序的简单顺序重复(SSR ) 重复在 1 和 6 之间的单位 ? bp 在在真核细胞的染色体编码和非编码的区域富有地发生，这些重复能影响基因表示。在这研究， Betula pendula (银桦树) 的 EST (表示顺序标签) 被分析为在 EST-SSRs，蛋白质注解，开的读框架(ORF ) ，设计教材，和识别 codon 的 silico 采矿重复。在 B。pendula，包含 SSR 的 EST 的频率是 7.8 ? 有 1SSR/4 的一般水准的 % 。78 ? EST 序列的 kb。18